Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms