Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms