Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV4P43268 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms