Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL9P32969 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL9P32969 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms