Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms