Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA1P29973 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA1P29973 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms