Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNA2P26232 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms