Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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CTSSP25774 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTSSP25774 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTSSP25774 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSSP25774 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSSP25774 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSSP25774 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSSP25774 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSSP25774 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSSP25774 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSSP25774 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSSP25774 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSSP25774 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSSP25774 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSSP25774 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSSP25774 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTSSP25774 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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