Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPD1P21695 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPD1P21695 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms