Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms