Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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