Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms