Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT3P12035 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT3P12035 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT3P12035 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT3P12035 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT3P12035 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT3P12035 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT3P12035 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT3P12035 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT3P12035 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT3P12035 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT3P12035 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT3P12035 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT3P12035 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT3P12035 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT3P12035 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT3P12035 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT3P12035 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT3P12035 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT3P12035 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT3P12035 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT3P12035 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT3P12035 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT3P12035 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT3P12035 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT3P12035 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT3P12035 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT3P12035 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms