Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SFTPCP11686 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SFTPCP11686 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SFTPCP11686 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SFTPCP11686 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SFTPCP11686 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTPCP11686 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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