Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ESRRAP11474 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms