Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSL3O95573 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms