Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX6O95503 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms