Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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HOXC11O43248 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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HOXC11O43248 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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HOXC11O43248 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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HOXC11O43248 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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HOXC11O43248 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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HOXC11O43248 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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HOXC11O43248 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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HOXC11O43248 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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