Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SOCS3O14543 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SOCS3O14543 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 296.8 ms