Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PCH4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PCH4 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PCH4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PCH4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
E9PCH4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
E9PCH4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
E9PCH4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PCH4 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PCH4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PCH4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms