Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MCRIP1C9JLW8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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