Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIMBP3BA6NNM3 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMBP3BA6NNM3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms