Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AGAP5A6NIR3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms