Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms