Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms