Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms