Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms