Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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UBQLN2Q9UHD9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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UBQLN2Q9UHD9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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UBQLN2Q9UHD9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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UBQLN2Q9UHD9 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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UBQLN2Q9UHD9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBQLN2Q9UHD9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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