Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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