Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms