Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms