Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PFDN4Q9NQP4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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