Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS4Q9NQG7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms