Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms