Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM60AQ9NP50 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms