Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms