Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPS2Q9BXY5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPS2Q9BXY5 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms