Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL6Q9BWW8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms