Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM2Q9BVW6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms