Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms