Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms