Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms