Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGAP1Q96PV0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms