Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms