Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms