Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms