Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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