Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1orf54Q8WWF1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf54Q8WWF1 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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