Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ZNF548Q8NEK5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ZNF548Q8NEK5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ZNF548Q8NEK5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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