Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms